Amazon har också gått med på att ge konsumenter ytterligare leveransalternativ när det inte råder ett behov av snabb leverans.
Vidare uppges säljare som använder Amazon Prime-medlemskapet inte längre vara låsta till Amazons logistiktjänster, utan kan fritt förhandla om villkoren med andra tjänster.
Uppgörelsen väntas bli tillkännagiven den 20 december.
EU lanserade i september sin nya lag kring digitala marknader, vars övergripande syfte är att luckra upp dominansen inom internetekonomin. Det är denna lag som inneburit att Amazon fått ge eftergifter. Att begå ett brott mot lagen kan bli kostsamt, då notan kan landa på upp till tio procent av ett bolags globala omsättning, och öka till 20 procent om övertrampet upprepas.