Knof och styrelsen ska nu vara överens om att han lämnar sin tjänst, framgår det av ett uttalande.
Skiftet sker mot en bakgrund av att italienska Unicredit under en kort period aggressivt gått in som ägare i banken med en andel om 21 procent.
Enligt uppgifter till Financial Times ska Orlopp vara emot att Unicredit tar över verksamheten. Även den tyska staten - som också är storägare - är emot ett övertagande.
Commerzbanks aktie sjunker 0,4 procent samtidigt som Unicredits lyfter 2 procent.