Tidigare har Reuters och Financial Times rapporterat om att affären väntades bli blockerad av EU.
"Förvärvet skulle ha gjort det möjligt för Booking att stärka sin dominerande ställning på marknaden för hotellresebyråer online (OTA) inom Europeiska ekonomiska samarbetsområdet (EES). Booking erbjöd inte några korrigerande åtgärder som var tillräckliga för att undanröja dessa betänkligheter", står det i uttalandet från EU-kommissionen.
Affären aviserades i slutet av 2021 och var värd runt 1,63 miljarder euro.
Booking avser att överklaga beslutet. I ett uttalande säger bolaget att det är övertygat om att kommissionen har fel både vad gäller fakta i målet och den lag som är tillämpligt på transaktionen. Booking pekar även på att både USA och Storbritannien godkänt affären.