I januari i år har Glencore också fått stoppa produktionen vid sin peruanska gruva Antapaccay efter protester.
Trots detta står bolaget kvar vid sin prognos om att producera 1,04 miljoner ton i år.
Zinkproduktionen föll 16 procent till 938 500 ton efter att bolaget stängt gruvor.
Vad gäller produktionen av kobolt, en viktig metall i bilbatterier, kom denna att öka med 40 procent efter att Glencore återstartat Mutanda-gruvan i Kongo.