"I morse gjorde en av våra handlare ett misstag när han gjorde en transaktion", meddelade den New York-baserade banken sent på måndagskvällen.
Citigroup för samtal med tillsynsmyndigheter och börser om händelsen, enligt en person med insyn i frågan.
Kursfallet i Stockholms spred sig snabbt till andra börser i Europa där viktiga index sjönk med 3 procent och börsvärden på 315 miljarder dollar sopades undan.
En talesman för Nasdaq Stockholm sa att den kortvariga nedgången inte var ett tekniskt fel från Nasdaq Stockholms sida.
"Vår första prioritet var att utesluta tekniska problem i våra system och vår andra prioritet var att utesluta en extern attack mot våra system. Vi har nu uteslutit båda", sa David Augustsson, talesman för Nasdaq Stockholm.
Nasdaq uttalade sig igår om att alla avslut under börsraset ligger fast.
Aktuellt
SENASTE
