Microsofts investering kan också ses som ett sätt att stoppa Kinas framfart i Mellanöstern, givet att G42 har kopplingar till Kina.
"När det gäller ny teknik kan man inte vara både i Kinas läger och i vårt läger", säger USA:s handelsminister Gina Raimondo till New York Times.
Raimondo har rest två gånger till Förenade Arabemiraten för att tala om säkerhetsarrangemang för detta och andra partnerskap.