Enligt den exekutiva ordern samlar Wechat automatiskt in mycket data om sina användare, i likhet med Tiktok. Man pekar på att andra länder som Australien och Indien har börjat begränsa eller till och med förbjudit Wechat.
Bannlysningen kommer börja gälla inom 45 dagar.
Index som följer kinesiska teknikaktier både i Fastlandskina och Hongkong faller kraftigt i spåren av den exekutiva ordern.
Det sker mot bakgrund av att utrikesministern Mike Pompeo förmedlade tidigare denna vecka att man har för avsikt att ta bort "opålitliga" kinesiska appar från den amerikanska appmarknaden.