"Domstolen kommer att utfärda ett skriftligt beslut, men informerade parterna om att den sannolikt inte kommer att godkänna uppgörelsen", står det i ett dokument som lämnades in på torsdagen till en federal domstol i Brooklyn.
Beslutet innebär att Visa och Mastercard kan behöva komma överens om en förlikning som är mer fördelaktig för handlare, eller ställas inför risken att gå till rättegång.