Enligt stämningen har Amazon bland annat tvingat säljare att använda sig av deras logistiklösning för att deras varor ska synas i Amazon Prime.
"Den stämningsansökan som FTC lämnar in i dag är felaktig vad gäller fakta och lagen, och vi ser fram emot att visa det i rätten", sade Amazons chefsjurist David Zapolsky i ett uttalande.