"Förhoppningen om en permanent lättnad har tyvärr inte förverkligats", säger Klaus Wohlrabe, chef för undersökningar på Ifo.
"Detta innebär att ekonomin för tillfället kommer att sakna stöd under recessionen", fortsätter han.
Störst är problemen inom den viktiga sektorn för maskinbyggande, där uppger 86,2 procent att man har problem. Tysklands gigantiska fordonssektor är också hårt drabbat. Totalt uppger 82 procent att man har problem.
Ifo är en av de tyngsta ekonomiska tankesmedjorna i Tyskland. Tidningen Frankfurter Allgemeine Zeitung menar att det är den tyngsta i landet.
Tyskland är Europas största ekonomi och en mycket viktig handelspartner för Sverige.