"Sedan början av juli 2021 har det funnits indikationer, inklusive utsläpp av kylvatten, i överensstämmelse med reaktorns drift", heter det i rapporten. Dessa indikationer ska inte ha funnits mellan december 2018 till början av juli i år.
Uppgifterna kommer efter att ledaren Kim Jong-un hotat att utöka sin kärnvapenarsenal, trots strikta sanktioner som stadigt har ökat sedan den första explosionsenheten för testanordningar 2006.
IAEA har inte haft direkt tillgång till Nordkorea sedan dess inspektörer sparkades ut ur landet 2009.