Beslutet kommer att påverka index såsom Stoxx Eastern Europe 50, som innehåller 15 ryska aktier, och Stoxx Global 3000.
Indexleverantörerna har varit under press att vidta åtgärder.
Fondbolag kan också hamna i kläm då de har produkter som är skapade för att exempelvis replikera ett index.
MSCI, som är mycket stora på index i tillväxtmarknader såsom Ryssland, har uppgett att man för diskussioner med sina kunder i frågan.