Nyheten kommer bara några dagar efter att Clark meddelat att han planerade att avgå från sin roll på Amazon den 1 juli efter mer än två decennier på företaget.
Clark byggde upp Amazons lagernätverk från bara några få anläggningar till ett enormt nätverk över i princip hela USA.
Flexport har som ambition att förbättra flödet av varor via transporter.