Åtalet gällde "misstanke om korrupt brottslig verksamhet i samband med skatterevisioner mot flera kommersiella företag" när Kazimir var finansminister i en tidigare regering, sade åklagarna i februari.
I oktober 2021 anklagade euroområdets särskilda åklagarmyndighet Kazimir för "korruptionsrelaterade brott" men drog tillbaka anklagelsen i juni förra året i väntan på en översyn. Den slovakiska polisen återupptog åtalet i november förra året.
Beslutet som tillkännagavs på torsdagen har inte vunnit laga kraft och kan överklagas, sade domstolen i ett uttalande.
Slovakiens centralbank avböjde att kommentera och hänvisade frågor till Kazimirs advokat, som också avböjt att kommentera. Inte heller ECB har velat uttala sig.