Emellertid har kritiska röster höjts som menar att detta kommer orsaka en rad problem. Bland annat kräver Golden Rice mycket mer bekämpningsmedel som vanliga bönder inte har råd med. Risodlaren Melanie Guavez befarar att med tiden kommer Bicolregionens jordbruksområden att bli mer sårbara för företagsövertaganden.
Bill and Melinda Gates Foundation har genom åren donerat miljoner dollar till IRRI för risforskning.