"Vi är besvikna över att FTC fortsätter att driva vad som har blivit ett uppenbart svagt fall, och vi kommer att motsätta oss ytterligare försök att fördröja möjligheten att gå framåt", säger Brad Smith, Microsofts vice ordförande.
Samtidigt måste Microsoft fortfarande lösa frågor med Storbritanniens konkurrensmyndighet innan affären kan slutföras.
Blickarna är nu riktade mot överklagandeprocessen och Microsofts potentiella avtal med CMA.