"Det finns en sak vi kan vidta åtgärder mot och det är att agera mot missbruk av marginaler inom raffinering", sade Macron.
Frankrike har skjutit upp tidigare planer på att låta bensinstationer att sälja med förlust med anledning av motstånd från små operatörer. Macron sade dock att han kommer att behålla detta som ett hot.
Bränslepriser är en explosiv politisk fråga i Frankrike, där en ökning av skatter 2018 utlöste Gula Västarna-rörelsen som utmynnade i månader av protester över levnadsstandarden.