Från SEC ska bolaget ha fått en lista med frågor om hur vissa kunder granskats. Frågorna rör bland annat varför bankens finansiella rådgivningsenhet gjort affärer med kunder som stängts av från E*Trade, vilken Morgan Stanley äger, på grund av röda flaggor.
SEC:s lista innehåller en miljardär med kopplingar till Ryssland som har sanktionerats av Storbritannien och en person som hävdade att hon var baserad i USA men vars aktivitet på E*Trade visade att hon befann sig på en karibisk ö och hade mer pengar på sitt konto än vad som skulle vara typiskt för någon med hennes angivna yrke.
Enligt WSJ är granskningarna ett tillägg till den utredning som redan initierats av centralbanken Federal Reserve, vilket tidningen rapporterade om i november.
Morgan Stanley föll 5,3 procent på torsdagen på uppgifterna.