USA:s beroende av import av mineraler ”ökar potentialen för risker till den nationella säkerheten, försvarsberedskapen, prisstabiliteten och det ekonomiska välståndet och motståndskraften”, sade Trump i ordern.
Utredningen bör vara klar inom 180 dagar, med rekommendation om huruvida Trump bör införa tullarna eller inte. Om det blir tullar, kommer storleken på dem att överstiga de ömsesidiga tullar som Trump tillkännagav i början av månaden, sade Vita huset.
Trumps agerande kommer efter att Kina infört restriktioner på vissa sällsynta jordartsmetaller, vilka är viktiga komponenter i bland annat framställningen av bilar och mobiler.
Kina är en av världens största producenter av 30 av de 50 mineraler som anses vara kritiska av U.S. Geological Survey, och har minskat sin export under de senaste månaderna.