Den korta positionen aviserades på tisdagen, samma dag som Saab satte ett nytt kursrekord.
Qube Research är en ökänd blankare, med totalt cirka 4,4 miljarder kronor i korta positioner.
Saabs största ägare är Wallenbergarnas investmentbolag Investor med drygt 30 procent av kapitalet och närmare 40 procent av rösterna.