MTPC, med huvudkontor i Osaka, är ett av världens äldsta läkemedelsbolag och fokuserar på immunologi, CNS, diabetes och metabola sjukdomar.
Som ett självständigt bolag planerar MTPC att stärka sin forskning och expandera genom licensiering och strategiska förvärv med stöd av Bain Capital, heter det.
Affären gör det också möjligt för Mitsubishi Chemical att fokusera på sina kärnområden, såsom elektrifiering, halvledarproduktion och livsmedel, skriver Wall Street Journal.
Affären förväntas slutföras under tredje kvartalet, men kräver godkännande från konkurrensmyndigheter.