Muñoz tillräder sin nya roll 1 januari och efterträder Jaehoon Chang, som utses till vice ordförande i styrelsen. Han har tidigare jobbat inom ledande roller på Nissan.
"Jose är en beprövad ledare med stor global erfarenhet och är perfekt lämpad att leda Hyundai när konkurrensen och osäkerheten i näringslivet ökar. Som vi nyligen beskrev på vår CEO Investor Day har vi en tydlig Hyundai Way-vision för att skapa en framtid centrerad kring mobilitet och energi. Tillsammans med Jose och resten av vårt ledarskapsteam ser framtiden mycket ljus ut för Hyundai", säger Jaehoon Chang.
Reuters skriver att utnämningen väntas hjälpa biltillverkaren att navigera i potentiella utmaningar som en andra Trump-administration innebär.
I den nya rollen kommer Muñoz fortsatt att vara underordnad Euisun Chung, barnbarn till företagets grundare, som har den andra delen av vd-rollen.